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Molegro Vitual Docker --计算机辅助药物设计软件。是跨平台(Windows/MacOSX/Linux)的预测蛋白质跟化学小分子结合的软件,软件提供在Docking过程中所需的所有功能,从分子结构的preparation到binding site的预测以及最后的小分子的结合未知及构造 (conformation)。软件本身由最新的演算法,可以提供高准确性的docking结果,以及简单好用的视窗界面操作。
Molegro Virtual Docking提供:
1、高准确性的docking结果,与其他docking软件想比较之下,为准确率最好的(MVD: 87%, Glide: 82%, Surflex: 75%, FlexX: 58%)
2、简单易用的软件界面:提供互动步骤方法 (wizard),让使用者可以很快的设定及执行docking,也针对docking结果提供完整的视觉及分析工具。
3、跨平台的整合:Molegro Virtual Docker 提供在Linux, Windows,及Mac平台的版本以及其结果可以在各平台存取
软件提供Docking的互动步骤来进行Docking的计算,在互动模式中,可以提供:
选择哪些分子要进行Docking计算;
选择哪个键结区域来进行Docking计算(MVD)会先自动计算出有可能的binding pockets
设定演算法及计算过程的参数设定
管理及增加额外的限制条件
在计算的过程中检查计算过程中的错误状况
其他特征:
a. 可以在Mac (PowerPC及Intel), Linux (32-bit及64-bit), 及 Windows的平台执行
b. 提供巨集的功能
c. 提供客制化的分子表面及骨干的表示<>